在水产养殖环境中的作用稳固水体菌藻相平衡：碳是藻类十分重要的营养元素，相当于是藻类的骨架。向水体中补充含碳源的物质能够补充有机碳，稳固水体菌藻相平衡，进而稳定水体的pH。例如很多水产养殖池塘中如果水中缺碳，藻类生长缓慢或者不稳定，补充像乙酸钠这样的碳源，可以为藻类的生长提供必要的碳元素，促进藻类的光合作用，增加水中的溶氧量；同时维持有益微生物在水体中的比例和活性，防止因天气突变等原因引起水质的剧烈变化，起到稳定养殖水体生态环境的作用。促进有益微生物和藻类繁殖：水体中的碳源富含发酵蛋白、同城氨基酸和还原糖时，能有助于促进有益藻类和微生物的繁殖生长，稳定水色。水产养殖中的藻类可以为养殖生物提供氧气、本地作为食物来源等重要作用，有益微生物则有助于分解水体中的有害物质、本地调节水体生态环境等，所以碳源通过促进它们的生长对整个养殖环境产生积极影响，如新生成的有益微生物能够分解残饵、粪便等，防止水中有机物的过度积累。

提高废水处理效率；合适的碳源投加能够提高污水中有机物的去除速率，从而降低处理所需的时间和成本。在生物处理工艺中，如果碳源不足，微生物代谢缓慢，那么污水中有机物的分解速度就会受到影响。以一个大型城市污水处理厂为例，如果进水的碳源含量较低，在不额外添加碳源的情况下，原本可能需要较长的水力停留时间才能将污水中的生化需氧量（BOD）降低到排放标准以下。而通过投加碳源，氨氮（NH? - N）等污染物的去除速度也会加快。比如在生物脱氮过程中，合适的碳源可以让反硝化细菌更好地进行反硝化反应，将硝酸盐等含氮污染物转化为氮气，使得污水中的氮含量更快地降低到排放要求范围内。同时，在生物除磷过程中，合适的碳源供应也有助于聚磷菌更好地吸收磷元素，提高磷的去除率。